Si alguna vez les sale de la nada este mensaje de error en MovableType al tratar de reconstruir:
permission denied at lib/MT/filemgr/local.pm line 104

Lo más seguro es que se perdió la ruta local de tu sitio.
En mi caso los del hosting hicieron cambios en la forma que tienen mis documentos.

Cambiaron de home5 a home6, así que solo fui a la configuración del MT y le cambié el número y listo trabajó sin problemas.

Así que si tienen ese error, no traten de cambiar nada hasta que sepan si su servicio de hosting han hecho algo.
Mándenle un email preguntando si han hecho algo diferente.